Eppendorf生物反應器指以活細胞或酶為生物催化劑進行細胞增殖或生化反應提供適宜環境的設備。其結構、操作方式和操作條件的選定對生物化工產品的質量、收率(轉化率)和能耗有密切關系，是生物反應過程中的關鍵設備。主要是指用于細胞培養、制藥生產、動植物組織培養、微生物發酵生產、生物制品制備、污水處理等實驗、生產提供反應環境的生產實驗設備，有時也會被稱為發酵罐或反應器。

　　該生物反應器具有在常溫常壓下操作要求能防染菌并且能蒸汽滅菌，制作材質對微生物或酶無毒害;酶常因底物濃度也不能太高，因而反應器體積相當龐大;反應前需接入菌種，為防止雜菌污染和活性衰退，一般采用分批釜式反應器;在發酵過程中，常是氣、液、固三相并存，流變學性質復雜。

　　Eppendorf生物反應器提供了應用廣泛的過程分析技術和過程控制策略的選擇。以恒定速率控制混合可使培養物保持均勻。細胞、營養物和溶解氣體分布均勻，較大程度地減少了組件的局部限制，并且可以準確、實時地測量整個過程參數。除了對培養物進行在線監測外，生物反應器甚至還可以在不干擾培養物的情況下對小體積樣品進行離線分析。

　　在大規模細胞擴增的情況下，攪拌槳的剪切力、攪拌速率都會對細胞得生長產生影響。一般來說，攪拌速率需要足夠高以保持微載體懸浮在培養物中并確保均勻混合以及充分的氣體轉移。同時，攪拌也應保持在低限速，因為過高的攪拌速率會因剪切應力而顯著損害細胞生長。