分子互作儀以前傳統的檢測生物分子間相互作用的探針分子和目標分子親和常數的方法如平衡透析法、光譜測量法、熱量測定法、脫氧核糖核酸酶足跡法等，大多需要熒光標記或放射性標記。本生物分子互作技術是基于SPR原理的新型生物傳感分析技術。
分子互作儀系統優點：
操作簡單：
適應多用戶的情況,經過半天的培訓就可以操作和使用；
不需要特別優化實驗條件,傳感器是拋棄式的。
更低使用和維護的成本：
相對其他的非標記檢測系統,耗材的成本低；
系統穩定,未來的使用和維護成本也低。
更寬的應用范圍：
直接檢測粗制的樣品,甚至是樣品中存在不溶解的成分；
耐受各種溶液環境,只有結合到傳感器表面的分子才會被檢測；
病毒顆粒等大分子樣品也能得到動力學結果；
檢測共價鍵結合的樣品。
分子互作儀使用前樣品和緩沖液的準備：
樣品準備：樣品包括耦聯到芯片表面的分子和在溶液中流過的樣品，稱作analyte。如果ligand是小分子，要檢查該分子結構上是否有可供耦聯的氨基基團，如果沒有需要考慮對分子進行修飾。
緩沖液準備：該實驗要求所有緩沖液都經過過濾和脫氣處理。如果緩沖液能夠耐受高溫的話，可以對緩沖液進行滅菌處理。這樣滅菌有脫氣的效果，同時也能保存更長的時間。
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